بهترین روش برای محافظت و جلوگیری از نفوذ sshd rootkit به سیستم عامل لینوکس تغییر پورت استاندارد ssh از ۲۲ به یک پورت غیر استاندارد است . روش دیگر که قوی تر و موثر تر نیز هست فعال سازی PubkeyAuthentication برای لاگین کردن و ورود به ssh است . برای انجام این تغییرات باید فایل sshd_config واقع در مسیر /etc/ssh/sshd_config را ویرایش کنید و تغییرات لازم را بدهید .
بعد از انجام تغییرات فوق باید سرویس ssh را ریستارت کنید .
